তিনি মু্ম্বই বিস্ফোরণ মামলায় দোষী সাব্যস্ত ইয়াকুব মেমনের মৃত্যুদণ্ডের বিরোধিতা করে রাষ্ট্রপতি প্রণব মুখোপাধ্যায়কে পিটিশন দিয়েছিলেন, তাই কেন তাঁকে উপরাষ্ট্রপতি পদে বাছাই করা হয়েছে, এহেন প্রশ্ন উঠছে শাসক শিবিরের তরফে। এজন্য প্রকাশ্যে তাঁরও তীব্র সমালোচনা করেছে শিবসেনা।
সে প্রসঙ্গে গোপালকৃষ্ণের বক্তব্য, ওরা মন দিয়ে ওদের কাজ করছে। ওরা যা বলেছে, সেটা ওদের মত। আমি মনে করি, মৃত্যুদণ্ড মধ্যযুগীয় ব্যাপার। ফাঁসির সাজা ভুল। এটাই আমার নীতি। পাকিস্তানে মৃত্যুদণ্ডপ্রাপ্ত ভারতীয় নাগরিক কুলভূষণ যাদবের হয়েও তিনি একই ধরনের পিটিশন দিয়েছেন বলে জানান তিনি।
বলেন, দেশের একজন স্বাধীন নাগরিক হিসাবে নিজের নীতি বাস্তবায়িত করা আমার কর্তব্য। আমি এতে বিশ্বাস করি। দুটি মানুষ, মহাত্মা গাঁধীও বাবাসাহেব অম্বেডকরের আদর্শে আমি অনুপ্রাণিত। দুজনেই মৃত্যুদণ্ডের বিরোধী ছিলেন, বলেছিলেন, প্রথাটা তুলে দেওয়াই উচিত, সঠিক কাজ।
তিনি কোনও রাজনৈতিক দল নয়, দেশের আমজনতার প্রতিনিধিত্ব করছেন বলে জানিয়ে গোপালকৃষ্ণ বলেন, সাধারণ মানুষ ও রাজনীতির মধ্যে যে দূরত্ব গড়ে উঠেছে, তিনি তা ঘুচিয়ে দেওয়ার চেষ্টা করবেন। রাজনীতির ওপর মানুষ বীতশ্রদ্ধ হয়ে উঠেছে, তাদের আস্থাভঙ্গ হয়েছে। আমি রাজনীতির ওপর মানুষের ভরসা ফেরানোর চেষ্টা করব।