প্রয়াত শঙ্করাচার্যর প্রতি শ্রদ্ধা জানিয়েছেন প্রধানমন্ত্রী নরেন্দ্র মোদী। তিনি ট্যুইট করে বলেছেন, ‘লক্ষ লক্ষ ভক্তর হৃদয়ে থাকবেন শঙ্করাচার্য। তিনি গরিব ও নিপীড়িত মানুষের জীবন বদলে দিয়েছেন।’ পশ্চিমবঙ্গের মুখ্যমন্ত্রী মমতা বন্দ্যোপাধ্যায়ও শঙ্করাচার্যর প্রয়াণে শোকপ্রকাশ করেছেন।
১৯৯৪ সালে চন্দ্রশেখরেন্দ্র সরস্বতী স্বামীগলের বদলে কাঞ্চি শঙ্কর মঠের প্রধান নির্বাচিত হন প্রয়াত শঙ্করাচার্য। কাঞ্চিপুরমের বরাধরাজা পেরুমল মন্দিরের অধ্যক্ষ এ শঙ্করের খুনের ঘটনায় জড়িত থাকার অভিযোগে গ্রেফতার হন শঙ্করাচার্য। তবে প্রমাণের অভাবে ২০১৩ সালে তিনি মুক্তি পান।