৫১ বছর বয়সি জাকির এইমুহূর্তে বিদেশে রয়েছেন। তাঁর বিরুদ্ধে সন্ত্রাসমূলক কাজকর্ম এবং টাকা নয়ছয়ের অভিযোগ রয়েছে। ২০১৬ সালের জুলাইয়ে ভারত ছেড়ে পালান জাকির। এদিকে ইতিমধ্যে বাংলাদেশের এক জঙ্গি গোষ্ঠীর তরফে জাবি করা হয়, তারা জাকিরের বক্তব্য থেকে নিজেদের কার্যকলাপ এগিয়ে নিয়ে যাওয়ার অনুপ্রেরণা পেয়েছে। ২০১৬ সালের নভেম্বরে ভারতীয় দণ্ডবিধি ইউএপিএ-র ধারায় জাকিরের বিরুদ্ধে মুম্বইয়ে মামলা দায়ের করে এনআইএ। ইতিমধ্যে কেন্দ্রীয় স্বরাষ্ট্রমন্ত্রকের তরফে ইসলামিক রিসার্চ ফাউন্ডেশন বা আইআরএফকে বেআইনি বলে ঘোষণা করা হয়।
গতবছর জুলাই ঢাকার ক্যাফেতে হামলার পর এই তদন্তকারী সংস্থার নজরদারিতে চলে আসেন জাকির।