গত ১৮ জানুয়ারি রাত ১১টা নাগাদ সন্তোষের বাড়িতে ঢুকে তাঁকে খুন করে হামলাকারীরা। ২১টি আঘাতের দাগ মিলেছে তাঁর শরীরে, বেশিরভাগই হাতে, পায়ে। সে সময় তাঁর স্ত্রী, ছেলেমেয়েরা বাড়িতে ছিলেন না। কিছু এসএফআই কর্মী শিক্ষা প্রতিষ্ঠান থেকে ঘুরতে গিয়ে আরএসএস কর্মীদের হাতে আক্রান্ত হয়েছেন, এই অভিযোগে তার বদলা নিতে সন্তোষের ওপর হামলা হয়। পরদিন বিজেপি হরতাল পালন করে।
সিপিএম নেতারা অবশ্য আগে সম্পত্তি সংক্রান্ত বিবাদের জেরে সন্তোষ আত্মীয়দের হাতে খুন হয়েছেন বলে দাবি করেছিলেন। কিন্তু পুলিশের বক্তব্য, রাজনৈতিক বিরোধেই এই হত্যাকাণ্ড।